Et cest parti pour 22 tours. Casey Stoner signe le holeshot devant Loris Capirossi et Nicky Hayden. Valentino Rossi est déjà 4e. 12e place pour Randy de Puniet qui ira au tapis après deux virages seulement dans un accrochage avec Alex Hofmann qui avait tiré tout droit. Rossi a gagné une place (3e) après s'est débarrassé de Capirossi. Gibernau est 4e devant Melandri et Colin Edwards. Suivent Nakano et Hopkins.
Deux tours plus tard, Hayden est dans la roue de Stoner (1e). Rossi est solidement installé au 3e rang et garde le contact avec les deux leaders. Il a dans sa roue arrière Capirossi et Gibernau. Ils sont huit dans un groupe compact alors que Rossi signe le meilleur tour en course. Carlos Checa est 13e au guidon de sa M1 aux couleurs de Dunlop avec toujours de gros soucis à l'épaule gauche.
Après 4 tours, Rossi a fait la jonction avec Stoner et Hayden. Capirossi, Gibernau et Edwards sont dans l'aspi du Champion italien. Dani Pedrosa (2e à Jerez) est parti péniblement mais remonte. Le triple Champion du Monde pointe 9e derrière Nakano. Abandon pour John Hopkins.
6e passage, Rossi tente une attaque sur Hayden et le passe mais l'Américain résiste. Au virage suivant, l'Italien porte une nouvelle attaque et le passe définitivement pour le gain de la 2e place. Devant Casey Stoner est en point de mire du 'Docteur'. 7/10e de secondes séparent les deux leaders. Le petit australien va tomber sous le coup du pilote Yamaha. Edwards a perdu une place (7e) et Checa en a gagné une (13e).
8e tour, la jonction entre Stoner et Rossi est faite. La course est bien lancée puisque derrière, Hayden ne lâche rien, tout comme Capirossi et Gibernau. Pedrosa passe Elias pour la 8e place. Après Hopkins, Chris Vermeulen abandonne à son stand. Comme à son habitude, Valentino Rossi est en observation derrière Stoner et l'attaque en bout de ligne droite au 10e tour. L'Italien creuse rapidement l'écart en tête de la course devant Stoner, Hayden, Capirossi, Gibernau, Melandri, Edwards, Pedrosa et Elias.
Mi-course, Rossi s'envole ! Hayden a passé difficilement Stoner qui pointe maintenant 3e après un début de course exemplaire. Capirossi et Gibernau sont 4 et 5e devant Marco Melandri et Pedrosa qui vient de passer Edwards. Capirossi (4e) est dans la roue de Stoner et devrait s'en débarrasser rapidement. Au tour suivant, c'est fait pour 'Capirex' qui prend la 3e place derrière Rossi et Hayden. Pedrosa double Melandri en bout de ligne droite et prend la 6e place. En vain, l'Italien résiste et repasse devant l'Espagnol. Edwards s'accroche à la 9e place derrière Elias et devant Nakano et Kenny Roberts Jr.
Plus que 7 tours, Rossi est toujours en tête avec 440/1000e d'avance sur Hayden. Avec Capirossi, Stoner et Gibernau, le groupe de tête est assez compact avec cinq pilotes roue dans roue séparés par 6 petites secondes. Valentino semble très à son aise même si Hayden est dans sa roue. Dani Pedrosa (6e) s'est enfin débarrassé de Melandri en demi-teinte depuis le début de la saison.
A trois tours de la fin, alors que la victoire semblait acquise pour Rossi, Hayden lui fait les freins en bout de ligne droite et le passe. Le Champion italien reste dans l'aspi du vainqueur de Laguna Seca 2005. Au tour suivant, Rossi repasse devant Hayden alors que Capirossi est de plus en plus présent au 3e rang. Marco Melandri est repassé devant Pedrosa pour la 6e place. Rossi fait le break et s'éloigne de ses poursuivants tout en gardant une sécurité. Stoner est tombé sous le coup de Gibernau pour la 4e place. Pedrosa est repassé devant Melandri en le tassant sur le bas côté. L'Espagnol a repris la 5e place.
Dernier tour, Rossi va égaler le record de victoire de Mike Doohan avec ses 54 succès. L'Italien gagne son premier GP cette saison devant Hayden, Capirossi, Gibernau, Stoner et Pedrosa. Edwards est 9e devant Carlos Checa (12e) et James Ellison (13e) au guidon de la seconde Yamaha YZR-M1 du team français Tech 3 Yamaha.
Au provisoire, Loris Capirossi conserve l'avantage devant Hayden et Pedrosa. Malgré sa contre-performance de Jerez, Valentino Rossi pointe déjà 4e avec 14 points de retard devant Toni Elias et l'épouvantail du week-end, l'Australien Casey Stoner.
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